选择合适的模板

在进行PCR反应之前，首先需要准备一套适用于特定DNA序列扩增的引物。合适的引物设计对于PCR反应至关重要，它可以确保目标基因段能够准确、高效地被扩增。此外，正确测量和校正引物浓度也是必不可少的一步，以避免过量或不足的问题影响实验结果。

控制温度循环

PCR仪通过控制高温和低温之间的转换过程来实现DNA扩增。通常，一个典型的热循环包括-denaturation（DNA双链分解）-annealing（引物与模板结合）-extension（扩增产物形成）的三个主要阶段。在每个阶段，都需要精确定义温度、时间以及其他条件以保证最佳效果。

使用优质水

在进行PCR时使用干净、无菌且纯度高的大于18MΩ·cm水是非常重要的一点，因为杂质会影响到整个实验过程中的结果质量。因此，在选购或者自制大样本水时都要格外小心，并且在所有操作中都要采取严格的手术抗生素手法来减少污染风险。

准备好良好的启动材料

除了上述所提到的设备和试剂之外，还需要有足够数量且质量可靠的原材料，即血液或组织样本。这部分工作往往要求较为专业化，可以采用不同的方法如冷冻保存或者速冻存储等方式来维持其生物学活性，从而保障后续实验数据的准确性。

技术参数设置

为了使得每一次运行都能达到预期效果，不同类型和规模的小分子检测可能对应不同的技术参数设置，如反应容器大小、总体积、插入片号等，这些都是由具体应用决定并根据实际情况调整。在此基础上还需考虑到不同研究目的下的响应速度，以及是否涉及多步程序处理等因素，这些都会直接关系到最终成果。

实验室环境管理

由于PCR是一个非常敏感的情境，因此环境管理也变得尤为重要。这包括但不限于保持室内温度稳定，避免电磁干扰，对于一些特殊条件下如高速冷却系统所需特别注意房间气流控制。此外还有防止化学品泄露，对所有人身穿防护服，有机溶剂处理后的废弃物按规定处置等方面，也是必须严格遵守的地方。